Вопросы, которые уже задавались, и на них есть ответы:
Скажите, при генотипировании в вашей лаборатории, если пациент имеет "на борту" несколько генотипов (с учетом уровня детектирования обоих), лаборатория определит оба? Или выявив один закончит анализ?
Если два генотипа, и каждый в концентрации выше предела детекции тест-системы, то выявятся оба генотипа. Чаще всего бывает сочетание генотипов 1b и 3a, поскольку это самые распространенные генотипы в России.
В ЦМД есть две услуги для определения генотипа гепатита С – отличаются по чувствительности, сроку исполнения и стоимости
1. Код 030206 «Вирус гепатита С (Hepatitis C Virus), определение генотипа (типы 1, 2, 3)»
Выполняется с помощью набора реагентов "АмплиСенс® HCV-1/2/3-FL" (срок исполнения до 3 дней, предел детекции 500 МЕ/мл) – не дифференцирует субтипы
При объеме экстракции 100 мкл, для "АмплиСенс® HCV-1/2/3-FL" аналитическая чувствительность составляет 500 МЕ, для "АмплиСенс® HCV-генотип-FL" (с дифференциацией субтипов) - 5000 МЕ.
Т.е. при выполнении 030206 («Вирус гепатита С (Hepatitis C Virus), определение генотипа (типы 1, 2, 3)») могут быть обнаружены и 1, и 2, и 3 генотипы вируса, если концентрация каждого из них не менее 500 МЕ/мл.
2. Код 030207 «Вирус гепатита С (Hepatitis C Virus), расширенное определение генотипа (типы 1a, 1b, 2, 3a, 4, 5, 6)» - определяются субтипы, дифференцируются 1а и 1b (важно для определенных схем терапии)
Выполняется с помощью набора реагентов «АмплиСенс® HCV-генотип-FL» (срок исполнения до 5 дней, предел детекции 5000 МЕ/мл).
Т.е., если у пациента два генотипа – 1b в концентрации не менее 5000 МЕ и 3a в концентрации не менее 5000 МЕ, то будут выявлены оба генотипа, если концентрация одного из них менее 5000 МЕ/мл, то этот генотип может не выявиться.
Особенность заказа и выполнения обеих услуг:
Если услуга 030206 или 030207 заказана вместе с услугой 030202 (Вирус гепатита С (Hepatitis C Virus), качественное определение РНК (плазма крови)) и получен отрицательный результат, то услуга 030206 или 030207 не выполняется и пациент ее не оплачивает.
Если выявлен генотип 2, то проводится дополнительное исследование методом секвенирования (БЕЗ ДОПОЛНИТЕЛЬНОЙ ОПЛАТЫ!!!) с целью выявления рекомбинантного генотипа RF1 2k/1b (в этом случае лечение назначается по схеме как для генотипа 1 (1а/1b)
Еще такой вопрос: какой должна быть подготовка к ПЦР?
На сайте Инвитро указано, что специальной подготовки не требуется.
На сайте CMD - три часа не принимать пищу.
При составлении правил подготовки пациента к ПЦР-исследованиям мы следуем инструкциям к наборам реагентов и методическим рекомендациям «Взятие, транспортировка, хранение клинического материала для ПЦР-диагностики», разработанными ФГУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора, Москва, 2008 г.
Для биоматериала "кровь (плазма)" методическими рекомендациями установлены следующие требования: "Для получения плазмы забор крови производят натощак или через 3 часа после приема пищи".
Т.е. в данном случае нужно "плясать от печки". Есть условия, при соблюдении которых производитель тест-систем может гарантировать заявленную точность оценки. При НЕсоблюдении этих условий открывается поле для творческих домыслов: "может быть повлияет, а может быть и не повлияет, но скорее всего нет, хотя все бывает".
Добрый день, подскажите, а почему вы не делаете анализ на резистентность, на платной основе.
Я думаю спрос был бы не маленький.
В настоящее время данное исследование проводится исключительно в рамках научно-исследовательской работы (НИР) на базе Референс-центра по мониторингу за вирусными гепатитами (РЦВГ) при ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. Принять участие в научно-исследовательской работе могут врачи, специализирующиеся в области диагностики и лечения вирусных гепатитов.
Для проведения исследования на определение мутаций резистентности вируса гепатита С, врач может направить пациента в лабораторию ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии. Обязательным условием является проведение расширенного ПЦР-исследования крови пациента на определение генотипа вируса в лаборатории ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии не позднее, чем за 5 дней до направления. Это требование обусловлено тем, что компоненты тест-системы (праймеры) являются субтипспецифичными, а само исследование в рамках НИР выполняется из того же образца плазмы крови. Исследование для пациентов выполняется бесплатно.
Для участия в научно-исследовательской работе врач должен заполнить форму направления на определение мутаций резистентности вируса гепатита С на сайте Референс-центра по мониторингу за вирусными гепатитами:
http://rcvh.ru . Всю информацию о научно-исследовательской работе, условиям выполнения исследования и выдачи результатов, а также регистрации врача на сайте можно уточнить, направив запрос по адресу электронной почты
info@rcvh.ru.
Резюмируя вышесказанное:
1) Направить пациента на исследование по определениям мутаций резистентности вируса гепатита С может любой врач-специалист, осуществляющий прием пациентов в любом лечебно-профилактическом учреждении не только в Москве, но и в других регионах РФ, а также за ее пределами.
2) Обязательное условие: накануне определения мутаций резистентности в лаборатории ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора должно быть проведено расширенное генотипирование вируса гепатита С (030207) (не позднее, чем за 5 дней).
3) В связи с тем, что исследование выполняется исключительно в научных целях, Референс-центр оставляет за собой право принять или отклонить заявку врача на проведение исследования мутаций резистентности вируса гепатита С.
Наши вопросы по поводу анализа на резистентность.
1.
kargyraa писал(а):А каков порог секвенирования штамма на мутации? 30% от общей популяции вирионов, 15%, 5% или, быть может, 1%?
Получили ответ:
Станислав Юрьевич писал(а):порог секвенирования 15% - этого вполне достаточно со слов вирусологов
2. После одобрения заявки врача пациент должен сдавать кровь непосредственно на ул. Новогиреевская или это возможно сделать в любом филиале CMD?
Ответ:
aloe vera писал(а):Это можно сделать в любом филиале сети CMD, а также в любом самостоятельном лечебно-профилактическом учреждении, выполняющем анализы в лаборатории ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.